הסביבה הרלוונטית של מוצרי מעבדה PCR כוללת בעיקר את ההיבטים הבאים:
טמפרטורה: מעבדת ה- PCR צריכה לשמור על טמפרטורה יציבה, בדרך כלל מומלצת להיות בין 18-25 מידה ולהימנע מתנודות טמפרטורה תכופות.
לחות: יש לשמור על הלחות היחסית בין 40%-60%. לחות גבוהה מדי או נמוכה מדי עשויה להשפיע על תוצאות הניסוי.
ניקיון: יש לשמור על המעבדה נקייה כדי להפחית את הסיכון לאבק וזיהום מיקרוביאלי. מומלץ להשתמש במנורות חיטוי אולטרה סגולות כדי לחטא את המעבדה באופן קבוע.
אוורור: צריך להיות מספיק מתקני אוורור במעבדה כדי לשמור על איכות אוויר טובה.
אטום הלם: יש למקם את מכשיר ה- PCR על פלטפורמה יציבה כדי למנוע הפרעות רטט.
ספק כוח: ספק מתח יציב, רצוי באמצעות מייצב מתח או אספקת חשמל ללא הפרעה (UPS).
פריסת חלל: יש לתכנן באופן סביר את המעבדה ולחלק אותם לאזורים שונים, כמו שטח הכנת הדגימה, שטח הגדרת תגובת PCR ושטח גילוי הגברה של PCR כדי למנוע זיהום צולב.